- Atatürk İlkeleri ve İnkılap Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi
- Atatürk Müzik Araştırmaları Merkezi
- Arkeoloji ve Sanat Tarihi Araştırma ve Uygulama Merkezi (ASTAM)
- Avrupa Birliği Araştırma Uygulama ve Dokümantasyon Merkezi (ADOM)
- Bilgisayar Araştırma ve Uygulama Merkezi (BAUM)
- Bitki, İlaç ve Bilimsel Araştırmalar Merkezi (AÜBİBAM)
- Çevre Sorunları Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Dil ve Konuşma Bozuklukları Eğitim, Araştırma ve Uygulama Merkezi (DİLKOM)
- Eskişehir Ekonomik ve Sosyal Araştırmalar Merkezi (ESAM)
- Halkbilim Araştırmaları Merkezi
- Engelli Çocuklar Eğitim Araştırma ve Uygulama Merkezi (İÇEM)
- Karikatür Sanatını Araştırma ve Uygulama Merkezi
- Kültürel Çalışmalar ve Çevre Eğitimi Merkezi (AKÇE)
- Mediko Sosyal Merkezi
- Psikolojik Danışma ve Rehberlik Merkezi
- Seramik Araştırma Merkezi
- Sivil Havacılık Araştırma ve Uygulama Merkezi
- Stratejik Araştırmalar Merkezi
- Televizyon ile Eğitim Öğretim ve Araştırma Merkezi
- Yabancı Diller Araştırma Merkezi
- Yaşamboyu Öğrenim Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Yaygın Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi
- Yurtdışında Yaşayan Türk Vatandaşlarının Sorunlarını Araştırma Merkezi
BİRİMLER
- Akademik Gelişim Birimi
- Anadolu Üniversitesi Çocuk Yuvası
- Anadolu Üniversitesi Fotoğraf Arşivi
- Bilgisayar Destekli Eğitim Birimi
- Deney Hayvanları Araştırma ve Uygulama Birimi
- Girişimcilik Eğitim ve Araştırma Birimi
- İleri Teknolojiler Araştırma Birimi
- İstatistiki Bilgiler Birimi
- Kurumsal İmaj Yönetimi ve Geliştirme Birimi
- Özürlü Öğrenciler Birimi
- Proje Birimi
- Senfoni Orkestrası (ASO)
- Sinema Kültürünü Geliştirme Birimi
- Üstün Yetenekliler Eğitim Programları (ÜYEP)
- Strateji Geliştirme Daire Başkanlığı
- Test Araştırma Birimi
- Tiyatro Anadolu
- Türk Mutfağı Araştırma ve Uygulama Birimi
- Türk Yükseköğretim Kurumları Arasında Öğrenci ve Öğretim Elemanı Değişimi (TR Değişim)
- Uluslararası İlişkiler Birimi
- Uzaktan Öğretim Araştırma Geliştirme Birimi